MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium perfringens ATCC 13124 chromosome

Total Repeats: 73009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008261	AGA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
2	NC_008261	AAT	2	6	426	431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799791
3	NC_008261	ATA	2	6	453	458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799791
4	NC_008261	ATA	2	6	526	531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799791
5	NC_008261	TTA	2	6	594	599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799791
6	NC_008261	AGA	3	9	665	673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
7	NC_008261	AGAA	2	8	694	701	75 %	0 %	25 %	0 %	110799791
8	NC_008261	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
9	NC_008261	ATG	2	6	721	726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799791
10	NC_008261	TGA	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799791
11	NC_008261	GCA	2	6	828	833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110799791
12	NC_008261	ATT	2	6	875	880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799791
13	NC_008261	GGA	2	6	888	893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110799791
14	NC_008261	ATGC	2	8	918	925	25 %	25 %	25 %	25 %	110799791
15	NC_008261	TTC	2	6	940	945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110799791
16	NC_008261	AGT	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799791
17	NC_008261	ATC	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799791
18	NC_008261	TTA	2	6	1003	1008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799791
19	NC_008261	GAT	2	6	1020	1025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799791
20	NC_008261	TTA	2	6	1068	1073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799791
21	NC_008261	GAT	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799791
22	NC_008261	ATTCA	2	10	1083	1092	40 %	40 %	0 %	20 %	110799791
23	NC_008261	AAG	2	6	1114	1119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
24	NC_008261	TTC	2	6	1122	1127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110799791
25	NC_008261	ATC	2	6	1172	1177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799791
26	NC_008261	AGA	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
27	NC_008261	ACC	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110799791
28	NC_008261	A	6	6	1296	1301	100 %	0 %	0 %	0 %	110799791
29	NC_008261	TA	4	8	1342	1349	50 %	50 %	0 %	0 %	110799791
30	NC_008261	CTA	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799791
31	NC_008261	AAATC	2	10	1357	1366	60 %	20 %	0 %	20 %	110799791
32	NC_008261	AAT	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799791
33	NC_008261	CT	3	6	1415	1420	0 %	50 %	0 %	50 %	110799791
34	NC_008261	ATA	2	6	1470	1475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799791
35	NC_008261	TAA	2	6	1478	1483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799791
36	NC_008261	ATT	2	6	1531	1536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799791
37	NC_008261	AGA	2	6	1569	1574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
38	NC_008261	GAA	2	6	1656	1661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799791
39	NC_008261	TGG	2	6	1664	1669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110799791
40	NC_008261	TAC	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799791
41	NC_008261	A	6	6	1702	1707	100 %	0 %	0 %	0 %	110799791
42	NC_008261	TGA	2	6	1727	1732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799791
43	NC_008261	AAAT	2	8	2099	2106	75 %	25 %	0 %	0 %	110798947
44	NC_008261	CTATAG	2	12	2116	2127	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	110798947
45	NC_008261	CAA	2	6	2152	2157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	110798947
46	NC_008261	AGTT	2	8	2275	2282	25 %	50 %	25 %	0 %	110798947
47	NC_008261	GA	3	6	2302	2307	50 %	0 %	50 %	0 %	110798947
48	NC_008261	TAA	2	6	2308	2313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110798947
49	NC_008261	TAAAAT	2	12	2330	2341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110798947
50	NC_008261	AGA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798947
51	NC_008261	TTA	2	6	2397	2402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798947
52	NC_008261	AGA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798947
53	NC_008261	CTT	2	6	2500	2505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110798947
54	NC_008261	TTC	2	6	2536	2541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110798947
55	NC_008261	TAT	2	6	2548	2553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798947
56	NC_008261	TAG	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110798947
57	NC_008261	ACAAT	2	10	2635	2644	60 %	20 %	0 %	20 %	110798947
58	NC_008261	AGA	2	6	2693	2698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798947
59	NC_008261	AACAT	2	10	2715	2724	60 %	20 %	0 %	20 %	110798947
60	NC_008261	ATT	2	6	2741	2746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798947
61	NC_008261	ATG	2	6	2803	2808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110798947
62	NC_008261	TTA	2	6	2811	2816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798947
63	NC_008261	AAAC	2	8	2850	2857	75 %	0 %	0 %	25 %	110798947
64	NC_008261	AAGG	2	8	2895	2902	50 %	0 %	50 %	0 %	110798947
65	NC_008261	TGA	2	6	2933	2938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110798947
66	NC_008261	AGA	2	6	2981	2986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110798947
67	NC_008261	TACT	2	8	3039	3046	25 %	50 %	0 %	25 %	110798947
68	NC_008261	A	6	6	3056	3061	100 %	0 %	0 %	0 %	110798947
69	NC_008261	TAT	2	6	3113	3118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110798947
70	NC_008261	AAG	2	6	3309	3314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799682
71	NC_008261	A	7	7	3451	3457	100 %	0 %	0 %	0 %	110799682
72	NC_008261	TGA	2	6	3466	3471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799682
73	NC_008261	TA	3	6	3570	3575	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
74	NC_008261	AATT	3	12	3586	3597	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
75	NC_008261	TA	3	6	3692	3697	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
76	NC_008261	CA	3	6	3718	3723	50 %	0 %	0 %	50 %	110801062
77	NC_008261	A	7	7	3839	3845	100 %	0 %	0 %	0 %	110801062
78	NC_008261	AATT	2	8	3886	3893	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
79	NC_008261	TC	3	6	3916	3921	0 %	50 %	0 %	50 %	110801062
80	NC_008261	AGA	2	6	3923	3928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801062
81	NC_008261	AAG	3	9	3959	3967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801062
82	NC_008261	TAT	2	6	4005	4010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801062
83	NC_008261	ATA	2	6	4027	4032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801062
84	NC_008261	GAAA	2	8	4044	4051	75 %	0 %	25 %	0 %	110801062
85	NC_008261	AT	3	6	4095	4100	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
86	NC_008261	GA	3	6	4123	4128	50 %	0 %	50 %	0 %	110801062
87	NC_008261	AT	3	6	4151	4156	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
88	NC_008261	AGA	2	6	4211	4216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801062
89	NC_008261	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
90	NC_008261	ATA	2	6	4255	4260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801062
91	NC_008261	A	6	6	4298	4303	100 %	0 %	0 %	0 %	110801062
92	NC_008261	GAT	2	6	4344	4349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801062
93	NC_008261	AT	4	8	4354	4361	50 %	50 %	0 %	0 %	110801062
94	NC_008261	ATA	2	6	4366	4371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801062
95	NC_008261	ATA	2	6	4446	4451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801062
96	NC_008261	TTA	3	9	4479	4487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110801062
97	NC_008261	GAT	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110801062
98	NC_008261	A	6	6	4544	4549	100 %	0 %	0 %	0 %	110801062
99	NC_008261	TAA	2	6	4561	4566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110801062
100	NC_008261	AGA	2	6	4580	4585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110801062
101	NC_008261	GA	3	6	4682	4687	50 %	0 %	50 %	0 %	110800243
102	NC_008261	GTA	2	6	4690	4695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110800243
103	NC_008261	TTG	2	6	4793	4798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110800243
104	NC_008261	GATA	2	8	4842	4849	50 %	25 %	25 %	0 %	110800243
105	NC_008261	TCA	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110800243
106	NC_008261	ATTA	2	8	4909	4916	50 %	50 %	0 %	0 %	110800243
107	NC_008261	ATG	2	6	5188	5193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
108	NC_008261	GTA	2	6	5257	5262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
109	NC_008261	TCA	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799437
110	NC_008261	TTG	2	6	5299	5304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110799437
111	NC_008261	TGA	2	6	5315	5320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
112	NC_008261	TACA	2	8	5355	5362	50 %	25 %	0 %	25 %	110799437
113	NC_008261	TGA	2	6	5387	5392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
114	NC_008261	GGC	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110799437
115	NC_008261	TGG	2	6	5507	5512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110799437
116	NC_008261	GAA	2	6	5700	5705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
117	NC_008261	TGA	2	6	5786	5791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
118	NC_008261	AGA	2	6	5795	5800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
119	NC_008261	AGA	2	6	5810	5815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
120	NC_008261	GGT	2	6	5832	5837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110799437
121	NC_008261	ATG	2	6	5884	5889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
122	NC_008261	ATG	2	6	5950	5955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110799437
123	NC_008261	TAA	2	6	5984	5989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	110799437
124	NC_008261	GGT	2	6	6006	6011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110799437
125	NC_008261	AATG	2	8	6050	6057	50 %	25 %	25 %	0 %	110799437
126	NC_008261	AGA	2	6	6066	6071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
127	NC_008261	CTG	2	6	6133	6138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110799437
128	NC_008261	AAACTA	2	12	6178	6189	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	110799437
129	NC_008261	AGA	2	6	6257	6262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
130	NC_008261	TTA	2	6	6300	6305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110799437
131	NC_008261	AAG	2	6	6329	6334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
132	NC_008261	AAG	2	6	6368	6373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110799437
133	NC_008261	TCA	2	6	6402	6407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110799437
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